据悉，该变异株采用华大智造MGISEQ-200RS基因测序仪进行测序，基因分型显示与南非上传的一个序列（GISAID ID：EPI_ISL_12713186）密切相关。

首次输入内地，Omicron BA.5序列获破译

2022年4月27日，从荷兰阿姆斯特丹起飞的KL857国际航班抵达上海市浦东国际机场，在常规隔离过程中一名乘客被报告为新冠核酸检测阳性并被诊断为轻症病例，并于5月13日使用华大智造MGISEQ-200RS进行测序。基因分型分析显示患者感染了新型冠状病毒关注变体奥密克戎变异株BA.5(VOC/Omicron BA.5)，与南非上传的一个序列（GISAID ID：EPI_ISL_12713186）密切相关（图1），有34个非同义突变发生在与BA.5的特征匹配的刺突基因中。

（图1 SARS-CoV-2多个谱系的系统发育树。导入的VOC/Omicron (BA.5)用箭头突出显示。右侧显示了其他不同颜色的Omicron亚系。）

Omicron BA.5更加严重？证据不足仍需持续监测！

目前Omicron VOC是全球流行的主要新冠变体，在Omicron谱系中BA.2及其后代谱系（名为BA.2.X的合并谱系）是主要变体（图2）。Omicron BA.5的序列于2022年3月15日首次上传到GISAID，样本来自2月25日在南非收集的患者鼻咽和口咽拭子。

根据世卫组织新冠每周流行病学进展报告（2022年5月25日），BA.2.X、BA.4和BA.5的相对比例分别为94%、0.8%和1%。BA.4、BA.5和BA.2.12.1都在刺突区域和基因座S：L452具有特征性突变，在首次检测到它们的国家中的流行率有所增加。BA.4与BA.5最近几周在南非的流行率有所上升，并已在3个月内传播到包括葡萄牙、美国在内的另外19个国家（地区）。

根据目前可用的数据，BA.4、BA.5和BA.2.12.1在曾发生BA.1流行的国家传播得更快；而在BA.2流行的国家发生病例较少，每个国家的疫苗接种程度也可能影响这些新兴的Omicron后代谱系。鉴于缺乏阐明表型差异的变化（例如严重程度）的证据，包括BA.5在内的所有Omicron后代谱系需要继续在Omicron VOC的体系下进行追踪。

（图2 截至2022年5月23日，按姐妹谱系划分的Omicron序列数量*）

*Omicron 姐妹谱系包括 Omicron 谱系 BA.1 和名为 BA.1.X、BA.2 的合并后裔谱系以及名为 BA.2.X、BA.3、BA.4 和 BA.5 的所有合并后裔谱系。 资料来源：来自 GISAID 的 SARS-CoV-2 序列数据和元数据，于 2022 年 5 月 23 日欧洲中部时间 10 点从 GISAID 中提取。

深圳卫视&壹深圳客户端记者：黄涛